Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBB6Q9BUF5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms