Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms