Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM175Q9BSA9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms