Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms