Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
C2orf48Q96LS8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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