Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD3Q96L08 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms