Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BORCS6Q96GS4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms