Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CLIP3Q96DZ5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLIP3Q96DZ5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLIP3Q96DZ5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLIP3Q96DZ5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLIP3Q96DZ5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLIP3Q96DZ5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLIP3Q96DZ5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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