Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC11Q96DB2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms