Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms