Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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USP9XQ93008 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
USP9XQ93008 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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