Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEO1Q92859 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEO1Q92859 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms