Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113Q902F9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113Q902F9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms