Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PHIPQ8WWQ0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms