Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HMGB4Q8WW32 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms