Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC4Q8WW27 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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