Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms