Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms