Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LRRC71Q8N4P6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms