Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDDC3Q8N4P3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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