Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC117Q8IWD4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms