Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNMB4Q86W47 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms