Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms