Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms