Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MED27Q6P2C8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms