Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms