Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L1Q676U5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms