Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms