Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC38Q5VT99 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms