Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCID2Q5JVF3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCID2Q5JVF3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms