Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms