Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms