Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GREB1Q4ZG55 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GREB1Q4ZG55 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms