Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIP1

ITPRIPL2, Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor-interacting protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPRIPL2Q3MIP1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITPRIPL2Q3MIP1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms