Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

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Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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