Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SGSM1Q2NKQ1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGSM1Q2NKQ1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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