Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IMPG1Q17R60 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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