Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM187BQ17R55 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms