Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CTF1Q16619 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTF1Q16619 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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