Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SGCAQ16586 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCAQ16586 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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