Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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