Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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TAF1AQ15573 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TAF1AQ15573 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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