Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IRF4Q15306 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms