Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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