Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARHGEF6Q15052 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms