Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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