Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCARF1Q14162 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCARF1Q14162 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms