Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GTF2H3Q13889 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2H3Q13889 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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