Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PEX6Q13608 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX6Q13608 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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