Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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IRF5Q13568 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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IRF5Q13568 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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IRF5Q13568 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
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IRF5Q13568 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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IRF5Q13568 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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IRF5Q13568 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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